Den største mikrobiomstudien veier tarmhelsen vår
De første resultatene av den største studien som noensinne har undersøkt det menneskelige mikrobiomet er i. De har viktige implikasjoner for vår diettpraksis, motstand mot antibiotika og vår mentale helse.
I 2012, Rob Knight, Ph.D., fra University of California (UC), San Diego, Jeff Leach, Ph.D., grunnleggeren av Human Food Project, og Jack Gilbert, Ph.D., som er fakultetsdirektør for Microbiome Center ved University of Chicago i Illinois, satte seg for å grunnlegge American Gut Project.
Målet med prosjektet var å lære mer om det menneskelige mikrobiomet - det vil si samlingen av gener som koder for alle våre mikrober.
Spesielt ønsket forskerne å vite hvor mange typer bakterier som lever i kroppene våre og hvor, og hvordan kostholdet og livsstilen vår påvirker sammensetningen av disse mikroberene.
For å oppnå dette brukte de såkalt borgervitenskap - praksis hvor publikum bidrar til forskning ved å tilby sin tid og personlige data til analyse.
De første resultatene av prosjektet er nå tilgjengelige, og de gir ledetråder til hva som holder tarmen sunn og bakteriell mangfoldig. Resultatene ble publisert i tidsskriftet mSystems.
Borgerforskere hjelper med å studere mikrobiomet
Som en del av prosjektet betalte deltakerne $ 99 for et sett som samlet fekale, orale og hudprøver av bakterier.
De måtte også svare på en undersøkelse som spurte om deres generelle helse og eventuelle sykdommer de måtte ha hatt, deres livsstil og kosthold.
I 2015 telte prosjektet 15 096 prøver levert av 11 336 mennesker over hele USA, Storbritannia, Australia og 42 andre land.
Forskerne brukte deretter genomisk sekvensering for å analysere en genetisk markør kalt 16S rRNA, et molekyl som er unikt for bakterier.
De studerte også settet av metabolitter i prøvene for å analysere andre molekyler og kjemiske forbindelser som kan være til stede.
Til slutt brukte forskerne en metode kalt haglgeværmetagenomikk - som er en innovativ og kraftig DNA-sekvenseringsmetode - for å analysere de genetiske dataene omfattende.
Betydningen av et variert, plantebasert kosthold
For det første antyder resultatene at et mer mangfoldig plantebasert kosthold gir en mer bakteriell mangfoldig tarm.
Spesielt hadde de som konsumerte mer enn 30 forskjellige plantetyper hver uke, mye mer varierte mikrobiomer enn de som bare konsumerte 10 eller færre plantetyper ukentlig.
Forskerne bemerker imidlertid at disse resultatene ikke nødvendigvis betyr at økende mikrobielt mangfold er en positiv ting for noens helse.
For det andre så deltakerne som rapporterte å ha spist mer enn 30 plantetyper per uke, å ha lavere motstand mot antibiotika.
Forskerne fant færre gener som indikerer antibiotikaresistens i fekale prøver av disse menneskene - det vil si færre gener som hjelper bakteriene med å unnslippe stoffene.
Mens studien er rent observasjonsfri og ikke kan konkludere med noe om årsakssammenheng, spekulerer forfatterne i at individer hvis kosthold inneholder færre planter, kunne kompensere med å spise enten kjøtt - som kan ha blitt behandlet med antibiotika - eller bearbeidet mat som har fått antibiotika tilsatt. .
Tarmbakterier og mental helse
Til slutt avslørte studien interessante sammenhenger mellom sammensetningen av tarmens bakterier og psykiske lidelser.
De som rapporterte å leve med posttraumatisk stresslidelse (PTSD), schizofreni, depresjon eller bipolar lidelse ble sammenlignet med sunne kontroller som hadde blitt matchet for alder, kjønn og kroppsmasseindeks (BMI).
Resultatene viste at personer som rapporterte om psykiske problemer hadde flere bakterier til felles med andre mennesker som rapporterte lignende problemer enn de gjorde med kontrollene.
Denne assosiasjonen var sterk uavhengig av kjønn, alder eller geografisk beliggenhet. Forskningen antyder også at noen typer bakterier kan være mer utbredt hos mennesker som lever med depresjon.
Disse funnene styrker koblingen mellom mental helse og tarmbakterier ved tidligere undersøkelser.
For eksempel fremhevet en nylig studie en sammenheng mellom angst og fravær av visse sunne tarmmikrober. En annen fant at visse bakterier er endret hos mennesker med PTSD.
Mot en ‘mikrobiom-GPS’
Daniel McDonald, Ph.D., vitenskapelig leder for American Gut Project ved UC San Diego School of Medicine, veier inn på betydningen av funnene. Han sier:
"Vi observerte et mye større mikrobielt mangfold enn tidligere mindre studier funnet, og det antyder at hvis vi ser på flere populasjoner, vil vi se mer mangfold, noe som er viktig for å definere grensene for det menneskelige mikrobiomet."
Knight har en lignende følelse og sier: "Det menneskelige mikrobiomet er komplekst, men jo flere prøver vi får, jo raskere vil vi være i stand til å avdekke de mange måtene mikrobiomet er assosiert med forskjellige helse- og sykdomstilstander."
"American Gut Project er dynamisk, med prøver som kommer fra hele verden daglig," legger Knight til.
“Analysen som presenteres i denne artikkelen representerer et enkelt øyeblikksbilde, men vi vil til slutt gå utover å lage kart over mikrobiomet til å lage et mikrobiom-GPS som forteller deg ikke bare hvor du er på det kartet, men hvor du vil dra og hva du skal gjøre for å komme dit når det gjelder kosthold, livsstil eller medisiner. ”
Rob Knight, Ph.D.
