Kreft: Disse 4 genene hjelper til med å forutsi utfallet
Omfattende forskning på rollen som tumorundertrykker p53 gir en større forståelse av de genetiske mutasjonene som er i spill i ulike former for kreft, samt å identifisere fire gener som kan bidra til å forutsi en persons utsikter.
De TP53 genet er ansvarlig for koding av det forskere kaller tumorprotein p53 - en tumorundertrykker som kan hindre cellene i å dele seg og spre seg for fort.
Forskere har dubbet TP53 ”vernet for genomet” på grunn av sin avgjørende rolle i å forhindre svulster og holde celledeling i sjakk.
Menneskelige kreftformer har ofte mutasjoner i TP53 genet, noe som får en av de kritiske forsvarsmekanismene mot kreft til å mislykkes.
De første studiene som identifiserte TP53 mutasjoner i kreft hos mennesker dukket opp på 1980-tallet, og siden den gang har forskere viet mye tid og ressurser til å avklare dens rolle i kreft.
Nå bruker den største studien i sitt slag tumorprøver fra over 10.000 kreftpasienter og ser på 32 forskjellige kreftformer for bedre å forstå rollen til TP53.
Dr. Larry Donehower, professor i molekylær virologi og mikrobiologi ved Baylor College of Medicine i Houston, TX, ledet den nye forskningen, som vises i tidsskriftet Cellerapporter.
Telltale 4-gener kan bidra til å forutsi utsikter
Dr. Donehower og team brukte fem forskjellige dataplattformer for å trekke ut 10 225 prøver fra 32 kreftformer. Ved hjelp av Cancer Genome Atlas (TCGA) klarte forskerne å vurdere rollen til p53-banen i disse 32 kreftene grundig.
Dr. Donehower og kolleger sammenlignet deretter TCGA-dataene med en annen database med 80000 genetiske mutasjoner som Dr. Thierry Soussi - professor i molekylærbiologi ved Sorbonne University i Paris, Frankrike - hadde samlet over en periode på 30 år.
Forskerne fant det TP53 mutasjoner forekom oftere hos mennesker som hadde dårligere syn. Videre fant analysen at “Mer enn 91% av kreftformene med TP53 mutasjoner viser tap av begge funksjonelle TP53 alleler, ”eller genvarianter.
Dr. Donehower forklarer: "I noen kreftgener ser du en kopi av de to gener som er tapt eller muterte," men "over 91 prosent av alle kreftformer mister begge TP53 gener, ikke bare en. ”
Det andre tapet av allelen, skriver forfatterne, skjedde ved "mutasjon, kromosomal sletting, eller kopi-nøytralt tap av heterozygositet" - det vil si genet duplisering. Lederforskeren bemerker også at denne siste prosessen skjedde mye oftere enn de tidligere trodde.
Det er viktig at forskningen også identifiserte fire gener som viste overekspresjon i mutant TP53 svulster. Ifølge forskerne kan disse fire genene "fortelle" om en kreftpasient har et godt syn eller ikke.
“Hvis du har et høyt uttrykk for disse fire genene, har du en pasient som er mer sannsynlig å ha en dårlig prognose [...] Omvendt, hvis den pasienten har et veldig lavt uttrykk for disse genene, vil han sannsynligvis overleve lenger og ha en god prognose. ”
Dr. Larry Donehower
“Det vil gi deg et bedre bilde av hvordan han vil klare seg enn bare å vite om han er mutant for TP53 eller ikke, ”fortsetter Dr. Donehower.
Til slutt studien sterkt assosiert TP53 mutasjoner med genomisk ustabilitet, et funn som er i tråd med TP53’S typiske rolle som” vernet for genomet. ”
Dr. Donehower kommenterer det unike med den nye forskningen og sa: "De fleste studier på TP53 fokus på en krefttype. ”
"Ser man på 32 forskjellige krefttyper, ser man at visse mønstre holder seg uansett krefttype."
Studie medforfatter og direktør for Cancer Genomics ved Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, kommenterer også betydningen av funnene.
Han sier: “Siden TP53 er en av de viktigste portvaktene i kreftforebygging, jo bedre vi forstår dette genet, desto bedre er vi i stand til å forstå kreftens grunnleggende biologi. Det vil føre til bedre terapier. ”
